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烈冰8周年!NovelBrain?云平臺再升級至V3.0,讓NovelBrain實現里程碑式飛躍! 時間:2018-03-22
烈冰NovelBrain®云平臺自上線以來,受到了廣大科研工作者以及企業的高度關注,并接受了眾多科研團隊的全方位、多層次的平臺功能和安全測試,在業界內掀起了一股NovelBrain云計算風潮。

烈冰一直以“Novel”為準則,向大家傳遞新的知識、新的方法、新的技術,以及新的產品。作為烈冰科技耗時八年推出的重量級產品,NovelBrain®云平臺更是致力于向所有科研和醫療行業工作者提供最新的、最便捷的、最高效的數據分析體驗,讓每一個普通人都可以輕松了解自己數據的價值,并賦予數據生物學意義。
為實現NovelBrain的崇高愿景,不斷進行自我更新,增加大數據分析計算產能,完善平臺運行機制,成為了NovelBrain®云平臺持續發展的必要環節。事實上,NovelBrain的研發團隊一直在努力,NovelBrain®云平臺從V1.0升級到V2.0,在給用戶帶來更多驚喜體驗的同時,我們也在更細致地去思考自身的不足。值烈冰8周年之際,再次更新升級的V3.0版本攜新功能驚艷面世,實現了NovelBrain的里程碑式飛躍!
新的V3.0上線了GCN(基因功能網絡繪制軟件),增加了自動化彈性結果報告系統,完善了最科學最前沿的生物信息學工具和人機交互文檔,同時還實現了人類基因組重測序分析的大幅度加速,4小時即可完成單樣本的分析,打破了人重分析的瓶頸。具體更新內容見下表:
看到這兒,大家可能還無法get到這波更新的意義所在,莫慌,烈小冰下面就帶您了解更新后的NovelBrain®云平臺V3.0可以實現的強大功能~
從該表可以看出,NovelBrain®云平臺針對不同客戶群體的多方面需求,在V2.0版本的基礎上進行了再次重大升級,全方位優化不同用戶的使用體驗。
針對不同需求的用戶,平臺主要做了以下幾點改進:
1. 提供了更準確和易懂的各類文檔。幫助用戶在毫無生信基礎的情況下,也能輕松上手平臺操作,快速準確靈活地整合生物信息軟件及Pipeline;
2. 增加了大量最前沿的分析工具。不僅涵蓋有甲基化、宏基因組、群體遺傳和單細胞測序等分析,同時還緊追國際最新進展,定制化開發了生物學意義挖掘模塊;
3. 重點加強了報告可視化,可讀性和關聯性更強,可自動瀏覽結果報告。上線了獨立自主開發的GCN功能網絡可視化軟件,可以在結果中直觀展示生物學意義的功能傳導路徑。增加了自動化結果報告判讀系統,方便醫療客戶在報告中快速了解臨床信息;
4. 自主開發NB三重調度加速框架,最終實現了人類重測序分析的大幅度加速,4小時即可完成單樣本的測序分析,較傳統的分析方法提高了十多倍速度;
5. 針對大型研究室、測序工廠和企業用戶,NovelBrain®云平臺V3.0額外升級了一系列的功能,降低了第三方軟件上線的工作量。針對科學研究的復雜性和可重復性,烈冰舍去復雜的文件配置,一鍵命令即可添加第三方軟件上線;對虛擬鏡像管理界面進行了全方位優化,Docker鏡像管理一體化;本著跨界共享的精神,開放了眾多平臺接口,更靈活地進行平臺對接,隨心所欲地進行軟件二次開發。
對NovelBrain®云平臺有一定了解的老師可能知道,為了滿足不同用戶的實際需求,NovelBrain®云平臺共推出了4款產品供大家選擇,分別是:Solar企業版公有云Diamond私有云Legend一體機Skywalker公有云。關于以上的更新內容,4款產品中存在些許差異,譬如Legend一體機和Skywalker公有云中,考慮到性能和安全性問題,暫時沒有添加第三方軟件的功能和API開放的升級。詳情見下表:
經過此次升級,NovelBrain®云平臺V3.0成為數不多的上線基因功能網絡繪制軟件的生物云平臺之一。接下來,烈小冰向大家著重介紹一下烈冰自主開發的GCN功能網絡可視化軟件上線將為平臺用戶帶來的便捷之處。
很多老師都知道,CytoScape是一款用來做生物分子網絡圖的作圖工具,其繪制的網絡圖可直觀展示基因互作關系。但對于生信小白來說,學習使用CytoScape軟件作圖的時間成本太高,操作起來也是相當繁瑣?
NovelBrain®云平臺V3.0上線的GCN功能網絡可視化軟件,只需幾步簡單的點擊操作和參數設置,即可一鍵實現網絡圖的繪制,并可對網絡節點的樣式和形狀進行任意修改。用戶如果想用高級功能,也可將數據導出并與cytoscape互通。
以下是NovelBrain®可以展示的圖片形式:
GO-Tree網絡
物種富集網絡
GCN上線只是NovelBrain®云平臺V3.0更新的眾多內容之一,由于篇幅問題,這里不再做過多介紹,對于其他更新板塊感興趣的老師可以直接聯系我們進行咨詢。NovelBrain®云平臺V3.0也歡迎各位老師進行壓力測試,并向我們提出寶貴的意見和建議。您的支持就是我們的最大動力!更多后續更新請持續關注哦!
至此,NovelBrain®云平臺V3.0成為國際上更懂科研、更了解臨床的生物醫療云平臺之一,實現了NovelBrain的重大突破。在過去的一個月里,NovelBrain已經部署至三家擁有NovaSeq的企業,達成長期戰略合作意向; 1家大型公有云機構達成意向協議;2家三甲醫院達成醫療合作框架,聯合建立臨床檢驗實驗室;與3家臨檢機構建立NovelBrain醫療云開發平臺。屆時,NovelBrain的公有云注冊用戶突破10000,充值合作用戶突破1000人,培訓專業人數突破400人。
更振奮的事情是,本次V3.0版本升級,會第一時間更新到老用戶的平臺上,烈冰安全穩定可靠的運維體系,為NovelBrain的熱愛者保駕護航。
烈冰8周年
烈冰于2010年成立至今,身經百戰,數百篇文獻支持。8年間歷經海量數據檢驗,已為600+國內外機構服務5000+項目,業務領域覆蓋科研機構、大型藥廠、醫院、檢驗機構等。從國內首篇circRNA研究文章(Sci Rep. 2016 Mar 2;6:22572.)到首個人類血液外泌體長鏈RNA數據庫exoRBase(www.exoRBase.org),從基于Ion Proton測序儀的第一篇轉錄組文獻(BMC Med Genomics. 2014 Aug 9;7:49)到第一篇高分轉錄組文獻(Nature. 2016 Feb 4;530(7588):98-102,NovelBrain®云計算平臺身經百戰,不懼考驗,最懂科研!
新的八年,新的考驗,烈冰陪您繼續前行!
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