上海时时乐走势图
服務熱線400-065-1811
當前位置:首頁 > 基因測序 > 16S rDNA測序

為什么使用16S rDNA測序?

16S rDNA是原核生物中編碼核糖體小亞基rRNA的DNA序列,承擔著許多重要的生物學功能。其具有9個高變區域(V1-V9)和10個保守區域,保守區反映細菌種屬間親緣關系,而高變區則反映了物種間的特異性。因此通過分析16S rDNA 可變區的序列即可得到各細菌的分類學特征,結合高通量測序可研究環境或者臨床樣本中的微生物組成及群落功能。

為什么選擇烈冰科技?

  • 更多的Reads數:烈冰科技深度優化的16S宏基因組測序服務,所測Reads數達100000條。同成本下相較于Miseq,能檢測更多的測序序列和稀有微生物;
  • 更高的數據質量:新一代HiQ,優于Q30級別的完美數據質量。具有更大的反應體系、更長的堿基讀長以及高保真度的堿基識別能力,有效提高了數據質量;
  • 更高的檢測靈敏度:均一的覆蓋度,高檢測靈敏度,以及更高的檢測通量,相較于PGM,更多的微生物物種被準確鑒定;
  • 更廣的覆蓋范圍:可覆蓋更廣的可變區,大幅提升后續對序列進行物種注釋時的準確度和靈敏度,更加真實地反映環境和人體微生物組的物種組成。

1、確定細菌的群落組成和豐度


2、比較不同樣本的群落差異


3、物種共富集分析


4、構建系統發育樹



1、醫學:采用糞便,血液,口腔等樣本對疾病發生的微生物學機制進行研究


2、環境:對空氣樣本進行研究,尋找空氣微生物與疾病、作物等之間的關聯性


3、植物作物:對植物內生菌進行研究,尋找植物內生菌與植物生長,營養價值等相關的菌種


4、畜牧:采用糞便,血液,口腔等樣本對畜牧種的種類優勢和疾病發生進行研究

(1)DNA樣品


濃度≥50ng/μL,體積≥60μL;


OD260/280介于1.8-2.0之間;


電泳檢測無明顯RNA污染,基因組條帶清晰、完整,無降解;


送樣時請標記清楚樣品編號,管口使用Parafilm膜密封;


樣品保存期間切忌反復凍融;


送樣時請使用干冰運輸。

(2)環境樣本(如土壤、植物根系、海水、腸道等),并詳細描述如土壤(硬度較大,接近石塊、取自河邊,松軟)。


組織樣品提取DNA要注明是內生菌還是外生菌。


取樣詳見Appendix。


實驗流程

數據分析流程

文獻示例

上海时时乐走势图